软件配置

配置说明

操作系统

Centos 7.5

集群管理

XCAT

文件系统

xfs

资源管理和调度

PBS

并行库

MPICH2，OpenMPI，Mvapich2

数学库

MKL、ACML、BLAS、LAPACK、ScaLAPACK、FFTW等函数库

常用生物软件

Anaconda3-2020.02，R-3.6.0，Python-3.7.7，Python-2.7，bedtools-2.29.2，bowtie2-2.4.1，cufflinks-2.2.1，MACS2-2.2.7.1， samtools-1.10，tophat-2.1.1，fastQC

功能节点

节点名

配置

登录/管理/存储节点

mgt

64G，16核

计算节点

node01-16

192G，28核

计算胖节点

bnode01，bnode02

512G，28核

队列名称

执行节点

节点个数

列队最大作业数

单节点内存

单节点cpu

batch

node01-node16

all

none

192G

28core

Long

node01-node16

16

none

192G

28core

bnode

bnode01-node03

3

none

512G

28core